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  • 柳欣
  • 研究員,研究組長,博士生導師
  • E-mail: xin.liu@@sibcb.ac.cn
  • 實驗室主頁: 
    個人簡介:
  •   2004年本科畢業(yè)于華中科技大學;2007年獲得華中科技大學碩士學位;2013年于德克薩斯大學奧斯汀分校獲得博士學位;2013-2019期間在MD安德森癌癥中心和德克薩斯大學西南醫(yī)學中心從事博士后研究;2019年起任中科院上海生化與細胞所研究員、研究組長。

    社會任職:
  •  
    研究方向:
  • 基因表達調(diào)控與功能基因組學
    研究工作:
  • 本研究組結(jié)合多組學分析,基因編輯,表觀遺傳干預,活細胞成像,分子生物學及生物化學等技術(shù)手段,研究細胞命運決定過程的基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控環(huán)路,以及調(diào)控異常對疾病發(fā)生發(fā)展的影響。這些研究不僅有利于我們深入理解多細胞器官和個體發(fā)育的分子機制,也為治療發(fā)育畸形、癌癥等疾病及組織器官再生提供潛在靶點。

    多細胞生物體中不同細胞的命運和功能是由特異的基因表達程序決定。細胞命運決定的調(diào)控機制一直是生命科學領域中的一個基本問題。人類基因組計劃發(fā)現(xiàn)用于存儲蛋白質(zhì)編碼信息的區(qū)域僅占基因組的很小一部分,而基因組中存在大量調(diào)控基因轉(zhuǎn)錄的非編碼序列,其中包括許多順式調(diào)控元件(Cis-Regulatory Element, CRE), 例如,增強子、啟動子、絕緣子等。這些順式調(diào)控元件作為整合內(nèi)、外源信息的平臺,結(jié)合特定RNA、轉(zhuǎn)錄因子和表觀調(diào)控蛋白,形成特異的染色質(zhì)空間結(jié)構(gòu),精確調(diào)控基因表達程序進而決定細胞命運。本實驗室主要研究方向集中在非編碼調(diào)控元件的功能和動態(tài)調(diào)控機制上。具體研究內(nèi)容包括:

      1. 順式調(diào)控因子及染色質(zhì)空間結(jié)構(gòu)調(diào)控基因轉(zhuǎn)錄的分子機制

      2. 干細胞命運決定過程中的表觀遺傳調(diào)控

      3. 癌癥等重大疾病的相關(guān)轉(zhuǎn)錄調(diào)控機理

    承擔科研項目情況:
    代表論著:
    1. Vo LT, Kinney MA, Liu X, Zhang Y, Barragan J, Sousa PM, Jha DK, Han A, Cesana M, Shao Z, North TE, Orkin SH, Doulatov S, Xu J & Daley GQ, Regulation of embryonic haematopoietic multipotency by EZH1. Nature. 2018 Jan 25;553(7689):506-510.
    2. Liu X*, Zhang Y*, Chen Y*, Li M*, Zhou F*, Li K, Cao H, Ni M, Liu Y, Gu Z, Dickerson KE, Xie S, Hon GC, Xuan Z, Zhang MQ, Shao Z, Xu J. In Situ Capture of Chromatin Interactions by Biotinylated dCas9. Cell. 2017; 170(5):1028-1043.e19
    3. Liu X*, Zhang Y*, Ni M*, Hui Cao, Signer RA, Li D, Gu Z, Hu Z, Chandel NS, DeBerardinis RJ, Zhou F, Shao Z, Xu J. Regulation of mitochondrial biogenesis in erythropoiesis by mTORC1-mediated protein translation. Nature Cell Biology. 2017; 19(6):626-638
    4. Huang J*, Liu X*, Li D*, Shao Z*, Cao H, Zhang Y, Trompouki E, Bowman TV, Zon LI, Yuan GC, Orkin SH, Xu J. Dynamic Control of Enhancer Repertoires Drives Lineage and Stage-Specific Transcription during Hematopoiesis. Dev Cell. 2016; 36(1):9-23.
    5. Qin JC*, Liu X*, Baffin B, Chen X, Choy G, Jeter C, Calhoun-Davis T, Li HW, Partial L, Pang S, Lin K, Hun JH, Ivanovo I, Suriname M, and Tang DG. The PSA-/lo prostate cancer cell population harbors self-renewing long-term tumor-propagating cells that resist castration. Cell Stem Cell. 2012 10(5): p. 556-69.
    獲獎及榮譽:
    研究組成員: